Команда межгалактического космического корабля «Энтерпрайз», под командованием капитана Джеймса Т. Кирка, убедившись, что планете ничего не угрожает, возвращается на Землю. Вернувшись, они обнаруживают, что кто-то проник в их организацию и теперь уничтожает ее изнутри. Лучшие агенты корпорации совершают жуткие преступления в самых крупных городах планеты, тем самым погружая Землю в настоящий хаос. Как оказывается позднее, за всем этим стоит некий злой гений, стремящийся уничтожить все человечество. Капитан Кирк, вместе со своей командой, отправляется в далекую часть звездной системы, чтобы найти и остановить злодея...